描述
RTS(常温稳定)DNase是一种高纯度的DNase I 酶,能在常温下长时间保持不失活。用于去除RNA样品中污染的基因组DNA。只需10 units(1μl)RTS DNase,即可在20min内去除30μg DNA。酶的活性能在常温下保持6个月之久,4℃下保持长达2年。RTS DNase™ Kit同时含有一种创新的树脂,可在反应过后特异性吸附去除RTS DNase和二价阳离子。无需加热或者使用EDTA来灭活DNase。树脂处理过后的RNA可直接用于下游实验。
酶活性
RTS DNase是首个无需分装冷冻,常温保存的DNase I酶。常温保存意味着无需担心反复冻融影响酶的活性。RTS DNase拥有足够的活性维持甚至超过试剂盒本身的效期,保证了每次RNA样品处理结果的一致性。
保护你的RNA
提取高质量RNA是件费时费钱的活。所以在DNase处理的过程中必须保护RNA避免其降解。RTS DNase™ kit只使用经过验证RNase-free的试剂,处理过程无需加热,使用EDTA或者刺激性的化学试剂,因此能很好地保护宝贵的RNA样品。
操作预览
样品加入1μl RTS DNase,加入适量10X RTS DNase buffer并定容稀释使10X RTS DNase buffer更终浓度达到1X,然后37℃孵育20min。再加入RTS DNase去除树脂去除反应液中的DNase和二价阳离子。离心把树脂沉淀下来,转移上清中的RNA样品到一个新的Tube管中。此时RNA可直接用于RT-PCR,或进行进一步分析应用。
研究与深入
图一,使用RTS DNase消化RNA样品中的基因组DNA。
使用RNA PowerSoil® Total RNA Isolation Kit提取两种不同类型的土壤样品。RNA样品使用RTS DNase™ Kit进行处理。琼脂凝胶电泳表明RNA样品中的DNA去过效果非常理想。
图二,.定量检测RTS DNase 处理前后,RNA中的DNA含量。
对图一中的4个样品使用16s通用引物和one-step qRT-PCR kit进行扩增分析。为了定量分析基因组DNA的下降水平,分别取1μl处理前后的RNA进行qRT-PCR。结果基因组DNA减少5 logs(>5循环),且少于背景DNA qPCR产生的曲线(红线)。标准曲线(灰色线)表明实验相关性为99%。
图三,RTS DNase去除树脂完全去除DNase。
RNA样品分别由RTS DNase™ Kit和竞争对手的试剂盒进行DNA消化以及DNase去除。操作严格按照官方说明书进行。通过MO BIO DNase-free认证办法,对DNase残留活性进行分析。条带5为阴性对照,不使用DNase。所有样品37℃孵育1h,65℃ 5min灭活。1%琼脂凝胶电泳展示如图,RTS DNase树脂成功地去除掉所有DNase(条带3-4),而竞争对手产品的树脂并不能完全去除样品中的所有DNase(条带1-2)。