|
随着细菌基因组研究的迅速发展，全基因组测序已逐步成为微生物基础研究的重要手段之一。新一代高通量测序技术大大减少了基因组测序的成本和时间，让更多实验室可以开展微生物基因组测序项目。
根据不同的研究目的和测序要求，细菌基因组测序可分为三种类型：细菌基因组Scanning、细菌基因组精细图和细菌基因组完成图。宝杰罗生物灵活应用Roche 454 长片段测序、Illumina 短片段高覆盖测序，结合454双末端测序(Paired-End)及Illumina末端配对测序(Mate-Pair Sequencing)技术，针对不同的基因组测序类型，提供专业、合理、高性比的测序服务。
优势
★拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，实验周期短，质量可靠。
★拥有ABI3730xl常规测序平台、Roche 454 FLX + 高通量测序平台和HiSeq 2500高通量测序平台，三种平台联合应用，优势互补，在细菌基因组测序中取得1+1+1>3的效果。
★技术人员经验丰富，每年完成数百个BAC全长测序、几十个微生物基因组测序的Gap Closing工作。
★拥有专业的生物信息团队和大型计算机，可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。
一、细菌基因组scanning
二、细菌基因组精细图
细菌基因组Scanning采用Illumina PE测序技术，对基因组进行100×深度测序，根据序列组装结果，以获取基因组序列信息。
技术路线
细菌基因组Scanning技术路线图
研究内容
1. 原始数据处理
2. 有效数据统计
3. 基因组拼接
4. 基因预测
5.基因功能注释
承诺指标
基因组覆盖度大于95%，基因区覆盖度达到98%以上，单碱基错误率低于十万分之一。
送样要求
1. 样品类型： DNA
2. 样品需求量（单次）： 小片段PE文库（300-500bp），≥5µg；
3. 样品浓度：≥50ng/µL
4. 样品纯度：OD260/280=1.8-2.0并确保DNA无降解，无污染。
5. 样品保存期间切忌反复冻融，送样时请使用冰袋或干冰运输。
三、细菌基因组完成图 |
