宝杰罗生物科技有限公司-技术服务BSA性状定位

BSA（bulked segregant analysis）译为混合分组分析法，指利用目标性状存在极端表性差异的两个亲本构建家系，在子代分离群体中，选取两组表型差异极端的个体分别构建混池，对混池和亲本进行全基因组重测序，检测与目标性状相关联的位点并对其进行注释，研究控制目标性状的基因及其分子机制。

研究类型

样本选取

测序平台

测序深度

项目周期

QTL

亲本：2个极端表型亲本

子代：极端表型个体混池，每个池至少20个个体

Illumina Hiseq PE400,150*2

亲本 ~20× 子代混池 ~30×

45天

MutMap

亲本：1个野生型表型亲本子代：极端表型个体混池，每个池至少20个个体

亲本 ~20× 子代混池 ~30×

技术线路：

BSA性状定位技术路线.jpg

信息分析内容：

序号	分析项目	类别	分析
1	数据过滤、整理及质量评估	A	√
2	数据质控	A	√
3	高质量数据获取	A	√
4	参考基因组整理	A	√
5	序列比对	A	√
6	序列比对结果概述	A	√
7	SNP检测统计	A	√
8	SNP 注释	A	√
9	InDel检测统计	A	√
10	InDel 注释	A	√
11	SNP index 计算	A	√
12	SNP index差异分布	A	√
13	目标区域性定位	A	√
14	候选SNP及基因筛选	A	√

A：标准信息分析 B：高级信息分析 C：个性化分析

分析结果展示

Pu H, Hui J, Zhu C, et al. Sparse panicle1 is required for inflorescence development in Setaria viridis and maize[J]. Nature Plants, 2017, 3(5):17054.