遗传图谱构建
遗传图谱(genetic map)又称遗传连锁图谱,是遗传标记在染色体上有序排列形成的连锁图谱,依据分子标记在染色体上的重组值,将染色体上的各个标记之间的距离和顺序标志出来,绘制而成。
遗传图谱反映遗传标记在染色体上的相对位置和遗传距离。
产品参数:
样本要求 |
测序技术 |
测序策略 |
适用范围 |
项目周期 |
F2、RIL、BC、DH
>100个样本F1>150个样本 |
全基因组重测序 |
亲本≥10×、子代≥2× |
有参物种,适合基因组小且简单的物种 |
80天 |
简化基因组测序 |
亲本≥5×、子代1~2× |
有参无参均可,针对基因组较大的物种
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信息分析内容:
序 号 |
分析项目 |
类 别 |
分 析 |
备 注 |
1 |
数据过滤、整理及质量评估 |
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2 |
数据质控 |
A |
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3 |
高质量数据获取 |
A |
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4 |
参考基因组整理 |
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5 |
序列比对 |
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6 |
序列比对结果概述 |
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7 |
SNP检测统计 |
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8 |
SNP 注释 |
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9 |
InDel检测统计 |
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10 |
InDel 注释 |
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遗传图谱构建 |
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QTLs定位 |
A |
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提供样品表型鉴定信息 |
A:标准信息分析 B:高级信息分析 C:个性化分析
分析结果展示
Nunes J R, Liu S, Pértille F, et al. Large-scale SNP discovery and construction of a high-density genetic map ofColossoma macropomum through genotyping-by-sequencing.[J]. Scientific Reports,2017, 7:46112.
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