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遗传图谱构建

遗传图谱构建 




 

遗传图谱(genetic map)又称遗传连锁图谱,是遗传标记在染色体上有序排列形成的连锁图谱,依据分子标记在染色体上的重组值,将染色体上的各个标记之间的距离和顺序标志出来,绘制而成。


遗传图谱反映遗传标记在染色体上的相对位置和遗传距离。


产品参数:



样本要求 测序技术 测序策略 适用范围 项目周期

F2、RIL、BC、DH

>100个样本F1>150个样本

全基因组重测序

亲本≥10×、子代≥2×

有参物种,适合基因组小且简单的物种

80天

简化基因组测序

亲本≥5×、子代1~2×

有参无参均可,针对基因组较大的物种


 
 

 

 

遗传图谱构建技术路线.jpg

信息分析内容:



序 号

分析项目

类 别

分 析

备 注

1

数据过滤、整理及质量评估

A


2

数据质控

A


3

高质量数据获取

A


4

参考基因组整理

A


5

序列比对

A


6

序列比对结果概述

A


7

SNP检测统计

A


8

SNP 注释

A


9

InDel检测统计

A


10

InDel 注释

A


11

遗传图谱构建

A


12

QTLs定位

A

提供样品表型鉴定信息

A:标准信息分 B:高级信息分 C:个性化分析



分析结果展示



遗传图谱构建分析结果.jpg

Nunes J R, Liu S, Pértille F, et al. Large-scale SNP discovery and construction of a high-density genetic map ofColossoma macropomum through genotyping-by-sequencing.[J]. Scientific Reports,2017, 7:46112.


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