全转录组测序的研究对象为特定细胞在某一功能状态下所能转录出来的所有RNA 的总和。包括mRNA、lncRNA、microRNA和circRNA等。可针对一份样本,同时分析mRNA、lncRNA、microRNA 和circRNA,揭示转录调控问题。可广泛应用于免疫机制研究、疾病领域研究、发育进化研究、致病机理研究和药物靶标研究等。
公司采用Ribo-Zero Gold rRNA Removal Kit(Illumina)去除总RNA中的rRNA,构建链特异性文库测序,获取lncRNA、mRNA、circRNA序列信息;采用TruSeq Small RNA Sample Prep Kit(Illumina)富集Small RNA测序,获取Small RNA序列信息。
通过对一份生物学样本的不同实验方式,获得四种RNA的序列信息。针对四种RNA的数据进行分析,并对具有microRNA结合位点的RNA分子进行竞争性内源RNA(ceRNA)分析,可深度挖掘基因功能及调控机制,明确RNA 分子间调控模式。在进行取样时,每一组样品建议设置至少3个生物学重复。